Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syde2E9PUP1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms