Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga1E1U8D0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga1E1U8D0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms