Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms