Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6E3

Chst13, Carbohydrate sulfotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst13D3Z6E3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chst13D3Z6E3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chst13D3Z6E3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chst13D3Z6E3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chst13D3Z6E3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms