Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms