Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptrhd1D3Z4S3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms