Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calhm1D3Z291 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms