Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3676D3Z236 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms