Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms