Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4950D3YUM8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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