Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms