Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1bB9EJ57 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1bB9EJ57 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms