Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms