Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia1B2RXQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia1B2RXQ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms