Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah3B2RWG3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms