Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms