Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc8B2RUS7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc8B2RUS7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc8B2RUS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms