Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4787B2RUD9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms