Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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