Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrn3B2RS91 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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