Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpb1B2RS76 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms