Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JrklB2RRL2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrklB2RRL2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms