Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms