Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms