Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms