Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palm3A2TJV2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms