Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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