Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl41A2AUC9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms