Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttll9A2APC3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll9A2APC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms