Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms