Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin4A2AMM0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms