Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms