Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ambra1A2AH22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms