Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myom3A2ABU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myom3A2ABU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms