Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms