Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm16A2A935 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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