Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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