Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm2A2A7B5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm2A2A7B5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms