Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms