Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l1A2A259 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms