Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71e1A1L3C1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms