Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930469K13RikA0A286YDB2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930469K13RikA0A286YDB2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms