Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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