Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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