Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20792A0A087WRF5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20792A0A087WRF5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms