Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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