Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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OtofQ9ESF1 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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OtofQ9ESF1 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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OtofQ9ESF1 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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OtofQ9ESF1 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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