Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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Ercc8Q8CFD5 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ercc8Q8CFD5 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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Ercc8Q8CFD5 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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Ercc8Q8CFD5 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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Ercc8Q8CFD5 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ercc8Q8CFD5 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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