Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Pggt1bQ8BUY9 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Pggt1bQ8BUY9 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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