Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc88cQ6VGS5 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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